在很多工业化国家中沙眼衣原体所致的性传播疾病增加很快，目前它所引起的生殖道感染的发病率已超过淋球菌感染。衣原体感染可以有症状或无症状，亚临床感染可持续存在较长时间，并且与有症状的衣原体感染一样可导致附睾炎及输卵管炎，造成严重的后果，如不育症及输卵管妊娠。产褥期及围生期的衣原体感染可导致婴儿肺炎。
沙眼衣原体的分离率在下列人群中最高：同性恋者、社会经济地位较低者、性活跃的年轻人，性侣多的人及未经产的妇女。
临床类型
男性患者
非淋球菌性尿道炎(NGU)一些研究证实，男性NGU的病因是沙眼衣原体。潜伏期一般为1~3周。典型的症状为尿道刺痒，伴有或轻或重的尿急、尿痛及排尿困难，但症状比淋菌性尿道炎为轻。在较长时间不排尿或清晨首次排尿前，尿道外口可逸出少量粘液分泌物，有时仅表现为痂膜封口或裤裆污秽，稍不细心则痂膜易被尿流冲失。有些病人可无任何症状，由于发病缓慢，症状不典型，约50%的病人在初诊时被误诊。
女性患者
女性患者的临床表现不如男性患者典型，因此诊断常很困难。开始时常无症状，如有症状，则常为合并阴道滴虫或白念珠菌感染的症状。有些妇女不发生症状，但她们可以是衣原体携带者，并可通过性接触使其性侣受传染，但这些妇女可在任何时候发病。
1。尿道炎 沙眼衣原体也是女性尿道炎的病因。50%具有尿频及排尿困难的女病人，细菌培养的结果不符合细菌性膀胱炎的诊断标准( 10 菌落形成单位/ml)。这些病人被归类于急性尿道综合征(acute urethral syndrome,AUS)。病人尿中菌落形成单位>10/ml，16例有脓尿的AUS患者，10例有沙眼衣原体的感染。
2。生殖道感染 沙眼衣原体原体为女性生殖道的病因也得到证实，子宫颈炎、子宫内膜炎及输卵管类均可由沙眼衣原体所引起。宫颈炎的分泌物呈粘液脓性伴有宫颈水肿，但临床症状不明显。
三、新生儿衣原体感染
1。新生儿眼炎 母亲患衣原体感染，35~50%新生儿在通过产道时可发生眼部感染。常出现于出生后7~14天，分泌物为粘液性或缺如，2/3病例为单侧发病，病程多为自限性，早期经适当的治疗，一般不会发生并发症，但可见到慢性持续性病例，反复发作可有瘢痕形成，导致视力丧失。
治疗
四环素对所有衣原体感染均有效。