由于初步应用抗逆转录病毒治疗，更改治疗方案应谨慎。要考虑患者近期的病史和体检状况；两次血浆HIVRNA的检测；CD4+T细胞的绝对值及其变化；坚持用药的评估；其它治疗选择；抗逆转录病毒疗法潜在的耐药方式；患者对新疗法的准备，包括药物的副作用、药物的相互影响、特殊饮食及可能需要更改的伴随药物。疗法无效可能有诸多原因，包括病毒对一种或多种药物耐药；改变药物的吸收或代谢；多种药物的药物动力学逆向影响治疗药物水平；患者不坚持该疗法。因此更改抗逆转录病毒疗法前，认真评估患者坚持用药情况十分重要，保健人员有助于评估。临床大夫应认识患者的精神疾患以及某些HIV感染者使用精神药剂紊乱。不适当的精神治疗机构可危害患者坚持用药。对精神疾患的确诊和干预能明显加强HIV治疗。

　　鉴别因用药无效或毒副作用而更改治疗方案是十分重要的。后者适当替换疑为引起毒副作用的药物；用药无效的病例，应有患者现病史、既往抗逆转录病毒治疗以及其它抗HIV相关药物的详细资料。抗逆转录病毒耐药检测充分了解了该疗法的药物活性。病毒对抗逆转录药物的耐药十分重要，但这不是治疗无效的唯一原因。每例HIV感染者在最初感染后出现病毒变异，甚至在治疗前就有病毒对单一药物的耐药变异，病毒仅部分被抑制，对抗病毒药物选择性复制。有效的疗法是持久抑制HIV复制，不易出现耐药变异。因此治疗目的应是降低血浆HIVRNA，使其在可检测范围以下，用最敏感的方法应<５０复制/ml，因此要给耐药设置遗传障碍。

　　三种不同的患者应考虑更改治疗：

　　1. 用抗逆转录病毒治疗，病毒得到不完全抑制的患者，如单一或双倍核苷治疗，可检测或不可检测到血浆病毒载量；

　　2. 联合用药治疗的患者，其病毒血症得到初步抑制至测不到的水平，但再度被测到；

　　3. 联合用药治疗，病毒血症从未被抑制到可检测范围以下。